Primer Premier V6.0 绿色版

软件分类：应用软件
软件大小： 52.58 MB
软件语言：简体中文
授权方式：免费软件
运行环境： Win ALL
更新时间： 2022-07-05

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软件介绍
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Primer Premier是一款在基因工程专业上会经常使用到的引物设计软件，我们可以通过Primer Premier来完成引物设计、序列编辑、酶切分析等多种操作，并且这款Primer Premier软件还可以帮助用户快速分析各项数据，获取最为准确的结论数据。

Primer Premier v6.0 绿色版

Primer Premier软件特色

Primer Premier软件还可以针对模板DNA 的来源以相应的遗传密码规则转换DNA 和氨基酸序列。软件共给出八种生物亚结构的不同遗传密码规则供用户选择，有纤毛虫大核(Ciliate Macronuclear)、无脊椎动物线粒体(Invertebrate Mitochondrion)、支原体(Mycoplasma)、植物线粒体(Plant Mitochondrion)、原生动物线粒体(Protozoan Mitochondrion)、一般标准(Standard)、脊椎动物线粒体(Vertebrate Mito-chondrion)和酵母线粒体(Yeast Mitochondrion)。Primer Premier软件有优秀的引物自动搜索功能，同时可进行部分指标的分析，而且容易使用，已被引物设计行业人士认为是一款相当不错的软件。

Primer Premier功能介绍

1.主要界面可分为序列编辑窗口（Genetank），引物设计窗口（Primer Design），酶切分析窗口（Restriction Sites）和纹基分析窗口（Motif）四大块

2.该软件就是用来进行引物设计的

3.可以简单地通过手动拖动鼠标以扩增出相应片段所需的引物

4.在手动的任何时候，下面显示各种参数的改变和可能的二聚体、异二聚体、发夹结构等。也可以给定条件，让软件自动搜索引物，并将引物分析结果显示出来

5.进行这些操作非常简单

Primer Premier安装方法

1、下载解压后双击PP600Installer.exe启动安装包，然后勾选同意协议点击Next

Primer Premier v6.0 绿色版

2、直接点击Next就好

Primer Premier v6.0 绿色版

3、选择好安装位置然后点击Install

Primer Premier v6.0 绿色版

4、等待安装完成

Primer Premier v6.0 绿色版

5、安装完成后点击Done结束安装

Primer Premier v6.0 绿色版

Primer Premier使用技巧

一、限制性酶切点分析及基元查找功能

1.其主要功能在主界面上一目了然。限制性酶切点分析及基元查找功能比较简单，点击该功能按钮后，选择相应的限制性内切酶或基元（如-10 序列，-35 序列等），按确定即可

2.常见的限制性内切酶和基元一般都可以找到,你还可以编辑或者添加新限制性内切酶或基元

二、引物设计

1.打开DNA序列后点击按钮primer，出现“search criteria”窗口，有多种参数可以调整

2.搜索目的（Seach For）有三种选项，PCR 引物（PCR Primers）、测序引物（Sequencing Primers）和杂交探针（Hybridization Probes）

3.搜索类型(Search Type)可选择分别或同时查找上、下游引物（Sense/Anti-sense Primer，或Both），或者成对查找（Pairs），或者分别以适合上、下游引物为主（Compatible with Sense/Anti-sense Primer）。另外还可改变选择区域（Search Ranges），引物长度（Primer Length），选择方式（Search Mode），参数选择（Search Parameters）等等

3.使用者可根据自己的需要设定各项参数。如果没有特殊要求，建议使用默认设置。然后按search，随之出现的Search Progress 窗口中显示Search Completed 时，再按OK，这时搜索结果以表格的形式出现，有三种显示方式，上游引物（Sense），下游引物(Anti-sense)，成对显示(Pairs)。默认显示为成对方式，并按优劣次序（Rating）排列，满分为100，即各指标基本都能达标

三、引物点击

1.点击其中一对引物，如第1#引物，并把上述窗口挪开或退出，显示“Peimer Premier”主窗口，所得结果分三部分，

2.模板及产物位置，中间是所选的上下游引物的一些性质，最下面是四种重要指标的分析，包括发夹结构（Hairpin），二聚体（Dimer），错误引发情况（False Priming），及上下游引物之间二聚体形成情况（Cross Dimer）

3.当所分析的引物有这四种结构的形成可能时，按钮由变成，点击该按钮，在左下角的窗口中就会出现该结构的形成情况

4.一对理想的引物应当不存在任何一种上述结构，因此最好的情况是最下面的分析栏没有，只有。值得注意的是中间一栏的末尾给出该引物的最佳退火温度

四、引物修饰编辑

1.在需要对引物进行修饰编辑时，如在5’端加入酶切位点，可点击，然后修改引物序列

2.若要回到搜索结果中，则点击按钮。如果要设计简并引物，只需根据源氨基酸序列的物种来源选择前述的八种遗传密码规则，反推至DNA 序列即可3.对简并引物的分析不需像一般引物那样严格

4.总之，“Premier”有优秀的引物自动搜索功能，同时可进行部分指标的分析，而且容易使用，是一个相当不错的软件

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